3D Slicerで3次元表面データを構築する
このページでは骨のCTデータから、骨の3次元モデルを作成する手順を紹介します。
3次元表面データって、3DCTの画像とは違うんですか? 病院のパソコンでみれますよね? 電子カルテで見れる3D画像は、技師さんがつくってくれた立体画像の1枚1枚を絵にしたものなんだよ。 連続写真みたいなもんだね。 だから自由に操作したり、しるしをつけたりはできないんだ。具体的には「Slicer」というソフトウェアを用います。
Slicerというのは無料ソフトで、CTデータを読み込んで、自分の関心がある部分の3次元モデルを構築することができます。
このページの内容- 0.Slicerをおすすめする理由
- 1.Slicerのインストール
- 2.SlicerでDICOMデータを読み込む
↓ Slicerの使い方「入門編」
↓ Slicerの使い方「実践編」
0.Slicerをおすすめする理由
①無料だからSlicerは無料です。 同様の機能をもったソフトで有名なのは Mimics, Avizoというソフトですが、どれも100万円近くします。 しかも、ライセンスが必要なソフトはPCを買い替えたときなどに設定の切り替えがあり、非常に手間がかかることがあります。
Slicerは無料ですが多機能で、必要な機能を備えています。 また、入手方法もホームページからダウンロードするのみです。
②オープンソースSlicerはopenソースのソフトウェアです。 また、オープンソースといって、ソフトの仕組みが公開されているので、他の人達がさまざまな便利なツールを作成しています。 画像処理に関して様々な拡張機能があり、これらをインストールしていくことで機能を増やすことができます。
では実際Slicerを使ってみましょう 3D Slicerの使用方法- 3D Slicerのインストール
- 3D SlicerでDICOMデータを読み込む
- ビューアーの設定
- 関心領域の決定
- 領域の選択(Volume Rendering)
- 切り出し(Crop Volume)
- 骨のセグメンテーションと3D表示
- セグメンテーションツールとセグメントの設定
- 骨領域の選択
- 3D表示
- セグメンテーションツールで対象物のみ抽出
- 連続領域の選択 : Islands
- 切り分け : Scissors
- 描画 Paintと消去 Erase
- 表面データの粗さの調整
- データの保存
- 表面データの保存
- 作成データの保存
1.Slicerのインストール
Slicerのホームページに行きます。
Googleで検索すればでてきます
Downloadのページに行きます。
OSにあったバージョンをダウンロードします。
ダウンロードが終わったらインストールします。
2.SlicerでDICOMデータを読み込む
Slicerをインストールしたら、CTデータを用いて3次元表面データを再構築します。
まずはCTからDICOMデータをデスクトップか、ハードディスクのフォルダにコピーしておきます。
CD-Rにデータをおいたまま処理するのは効率が悪いのであまりおすすめしません。
読込のたびにCDリーダーの速度が処理速度となってしまいます。
DICOMデータが準備できたらさっそくSlicerを開いてみます。
Load DICOM Dataのボタンからデータを開きます。左上にも同じ機能のアイコンが出ているので、ここからでもいけます。
左ウィンドウのImport Dicom filesというボタンを押します。
DICOMファイルが入った親フォルダを選択し、インポートを押します。 ここまででデータがデータベースに取り込まれます。
データベースのデータを選択し、Loadを押します。するとCTが読み込まれます。
作業用の画面にCTの3方向のスライスデータが表示されます。
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